Stacja Badawcza MIR w Świnoujściu kontynuuje badania wód estuarium Odry zapoczątkowane w roku 1949 przez Laboratorium Rybackie w Trzebieży, które w roku 1951 zostało przeniesione do Świnoujścia i przemianowane na Oddział MIR w Świnoujściu.

Od roku 1999 Oddział ten funkcjonuje w strukturze MIR w Gdyni jako Stacja Badawcza. Pracownicy Stacji realizując tematy badawcze prowadzone przez Zakład Oceanografii i Ekologii Morza oraz Zakład Zasobów Rybackich MIR w Gdyni , kontynuują ponad 60 –letnie badania zasobów rybackich,(w tym mechanizmy rekrutacji ryb użytkowych) oraz badania hydrobiologiczne wód Zalewu Szczecińskiego i Zatoki Pomorskiej.

Stacja uczestniczy także w Narodowym Programie Zbierania Danych Rybackich.

Aktualnie Stacja zatrudnia 7-miu pracowników merytorycznych i 3-ch pracowników administracyjnych.
Do badań terenowych i pobierania prób wykorzystywana jest pełno pokładowa łódź motorowa „Stynka II”.

Stacja Badawcza MIR w Świnoujściu reprezentuje MIR w Gdyni w Stowarzyszeniu Lokalna Grupa Rybacka – Zalew Szczeciński z siedzibą w Świnoujściu powołanej w celu realizacji założeń osi priorytetowej 4 Programu Operacyjnego „Zrównoważony rozwój sektora rybołówstwa i nadbrzeżnych obszarów rybackich” – PO RYBY 2007-2013.